Fakta Mutasi Virus Corona N439K Inggris, Disebut Lebih Pintar

Virus corona SARS-Cov-2 yang bermutasi jadi varian N439K mendapat perhatian setelah Ikatan Dokter Indonesia (IDI) mengimbau agar warga waspada.

Pasalnya varian ini sudah menyebar di 30 negara dan disebut lebih "pintar" dari varian corona lain. Varian virus ini lebih pintar karena menurut Ketua Umum IDI Daeng M. Faqih mutasi membuat virus ini tak dikenali antibodi.

"Ini berarti virus memiliki banyak cara untuk mengubah domain imunodominan untuk menghindari kekebalan (tubuh manusia) sekaligus mempertahankan kemampuan untuk menginfeksi dan menyebabkan penyakit," kata Gyorgy Snell, Direktur Senior Biologi Struktural di Vir Biotechnology California, AS.

Virus ini pertama dideteksi pada Maret 2020 di Skotlandia, Inggris. Penelitian tentang varian ini sudah diterbitkan di Jurnal Cell sejak 25 Januari dan sudah ditinjau rekan sejawat (peer reviewed). 

Sementara dari tingkat penularan, virus ini masih serupa dengan virus corona awal. Tidak seperti varian B117 yang juga berasal dari Inggris yang punya kemampuan penularan lebih tinggi.

Peneliti menunjukkan bahwa mutasi ini memberikan resistansi terhadap antibodi serum dan banyak antibodi monoklonal penawar, termasuk salah satu bagian dari pengobatan yang diizinkan untuk penggunaan darurat oleh Badan Pengawas Obat dan Makanan Amerika Serikat (AS).

Temuan penting dari makalah penelitian ini adalah tingkat variabilitas yang ditemukan pengikatan Reseptor Imunodominan (RBM) pada protein spike virus Corona.

Setelah ditelusuri, varian ini merupakan garis turunan kedua dari varian B.1.258 yang telah muncul secara independen di negara-negara Eropa.

Persamaan dengan varian B117 yang sebelumnya muncul adalah letak mutasi yang sama-sama terjadi di protein-S (spike protein) virus. Spike protein adalah bagian virus corona yang bertugas menempel ke sel manusia di bagian ACE2, agar virus bisa menginfeksi.

Studi sel juga melaporkan struktur kristal sinar-X dari N439K RBD. Hasilnya menunjukkan bahwa mutasi baru ini memperkenalkan interaksi tambahan antara virus dan reseptor ACE2.

Reseptor ACE2 ada di sel manusia yang jadi pintu masuk protein-S (spike protein) virus corona (farmasi.ugm.ac.id)

"Perubahan asam amino tunggal (asparagin menjadi lisin) memungkinkan pembentukan titik kontak baru dengan reseptor ACE2, sejalan dengan peningkatan dua kali lipat dalam afinitas pengikatan. Oleh karena itu, mutasi meningkatkan interaksi dengan reseptor virus ACE2," kata Gyorgy seperti dikutip Eurekalert (28/1). 

Setelah peneliti menentukan bahwa mutasi N439K tidak mengubah replikasi virus, mereka mempelajari apakah mutasi tersebut memungkinkan kekebalan imunitas yang dihasilkan dari antibodi, dengan menganalisis peningkatan lebih dari 440 sampel serum dan lebih dari 140 antibodi monoklonal dari pasien yang pulih.

Menurut peneliti, ada peningkatan porsi antibodi monoklonal dan sampel serum secara signifikan berkurang oleh N439K.

Peneliti mencatat bahwa salah satu tantangan dalam mempelajari varian virus Corona adalah terbatasnya jumlah pengurutan secara menyeluruh.

Lebih lanjut, Daeng menyoroti penularan virus yang bisa terjadi melalui aerosol sehingga sulit dikendalikan pada orang-orang asimtomatis atau tidak bergejala.

Daeng menjelaskan penyebaran dalam bentuk droplets berukuran kurang dari 0,8 - 10 mikron bisa menetap di udara hingga satu sampai tiga jam. Ukuran aerosol virus yang paling lazim terhirup sekitar 0,5 sampai 5 mikron.

Potensi tersebut mengindikasikan penularan riskan terjadi pada ruangan tertutup dengan udara yang berputar atau menggunakan pendingin ruangan. Pada ruangan dengan sirkulasi udara yang buruk dan kurang cahaya ultraviolet, virus bisa bertahan hingga tiga jam dalam ruangan.